По сравнению с общими правилами проведения выездных налоговых проверок, установленными частью первой НК РФ, статья 346.42 НК РФ закрепляет, что выездная налоговая проверка инвесторов и операторов соглашения о разделе продукции проводится налоговым органом по месту нахождения участка недр или по месту постановки налогоплательщика на учет. Проверкой может быть охвачен любой период времени в течение срока действия соглашения, но не более трех календарных лет деятельности налогоплательщика, непосредственно предшествовавших году проведения проверки. При этом выездная налоговая проверка указанных лиц не может продолжаться более шести месяцев.
