Уполномоченный орган осуществляет следующие полномочия:
1) определение и реализация государственной политики в сфере создания и функционирования специальных административных районов;
2) утверждение типового договора об осуществлении деятельности;
3) утверждение типовой формы арбитражного соглашения о передаче споров, вытекающих из договора об осуществлении деятельности, в арбитраж (третейское разбирательство), администрируемый постоянно действующим арбитражным учреждением;
4) определение требований к структуре отчета управляющей компании и сроков его размещения в информационно-телекоммуникационной сети "Интернет";
5) иные полномочия в соответствии с настоящим Федеральным законом.