1. Председатель апелляционного военного суда назначается на должность Президентом Российской Федерации сроком на шесть лет по представлению Председателя Верховного Суда Российской Федерации и при наличии положительного заключения Высшей квалификационной коллегии судей Российской Федерации.
2. Председатель апелляционного военного суда наряду с осуществлением полномочий судьи соответствующего суда, а также иных процессуальных полномочий в соответствии с федеральными законами осуществляет следующие функции:
1) организует работу суда и руководит организацией работы судебных коллегий суда;
2) устанавливает правила внутреннего распорядка суда на основе утверждаемых Советом судей Российской Федерации типовых правил внутреннего распорядка судов и осуществляет контроль за их выполнением;
3) созывает президиум апелляционного военного суда и председательствует в его заседаниях;
4) распределяет обязанности между своими заместителями, судьями;
5) организует работу по повышению квалификации судей и работников аппарата суда;
6) организует работу по изучению и обобщению судебной практики, анализу судебной статистики;
7) вносит в Высшую квалификационную коллегию судей Российской Федерации представления о квалификационной аттестации судей апелляционного военного суда, а также о приостановлении или прекращении их полномочий;
8) организует работу суда по приему граждан и рассмотрению их обращений;
9) осуществляет общее руководство деятельностью аппарата суда, в том числе назначает на должность и освобождает от должности работников аппарата суда, а также распределяет обязанности между ними, принимает решение о поощрении работников аппарата суда или о привлечении их к дисциплинарной ответственности, организует работу по повышению квалификации работников аппарата суда;
10) регулярно информирует судей и работников аппарата суда о своей деятельности и о деятельности суда;
11) осуществляет иные полномочия по организации работы суда.
3. В случае приостановления или прекращения полномочий председателя апелляционного военного суда его полномочия осуществляет по решению Председателя Верховного Суда Российской Федерации один из заместителей председателя суда, а при их отсутствии - по решению Председателя Верховного Суда Российской Федерации один из судей этого суда.