При применении статьи 146 НК РФ необходимо учитывать, что если налогоплательщик передает в безвозмездное пользование помещение, то он обязан исчислить и уплатить в бюджет сумму НДС. Причем налоговая база определяется, исходя из рыночной стоимости услуг по передаче в пользование.
Статьей 270 НК РФ установлен перечень расходов, которые налогоплательщик не вправе учитывать при налогообложении прибыли.
В связи с тем что НК РФ не раскрывает понятие "выполнение строительно-монтажных работ для собственного потребления" в правоприменительной практике возникают споры между налогоплательщиками и налоговыми органами по вопросу применения подпункта 3 пункта 1 статьи 146 НК РФ.
Согласно позиции официальных органов (письмо УФНС России по г. Москве от 31.01.2007 N 19-11/8073) на основании статьи 11 НК РФ в данном случае следует руководствоваться определениями, содержащимися в нормативных актах Госкомстата России.
Минфин России в письме от 31.12.2009 N 03-07-11/341 делает вывод о том, что передача права собственности на товары, результатов выполненных работ, оказание услуг на безвозмездной основе в целях налога на добавленную стоимость признаются реализацией товаров (работ, услуг). Поэтому, по мнению финансового ведомства, передача арендатором арендодателю на безвозмездной основе неотделимых улучшений арендуемого имущества облагается налогом на добавленную стоимость в общеустановленном порядке.