При применении статьи 346.1 НК РФ следует учитывать, что одновременно налогоплательщик может совмещать применение ЕСХН только с ЕНВД.
Одновременно применять ЕСХН и общую систему налогообложения (по разным видам деятельности) невозможно, равно как и невозможно совмещение ЕСХН и УСН (см. подпункт 13 пункта 3 статьи 346.12 НК РФ).
Кроме того, необходимо учитывать, что на основании статьи 2.1 Федерального закона от 06.08.2001 N 110-ФЗ, с 1 января 2008 года по 31 декабря 2014 года под сельскохозяйственными товаропроизводителями, не перешедшими на систему налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей (единый сельскохозяйственный налог), по деятельности, связанной с реализацией произведенной ими сельскохозяйственной продукции, а также с реализацией произведенной и переработанной данными организациями собственной сельскохозяйственной продукции, понимаются сельскохозяйственные товаропроизводители, отвечающие критериям, предусмотренным пунктом 2 и подпунктом 1 пункта 2.1 статьи 346.2 НК РФ.
Налоговая ставка по налогу на прибыль организаций для сельскохозяйственных товаропроизводителей, не перешедших на систему налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей (единый сельскохозяйственный налог), по деятельности, связанной с реализацией произведенной ими сельскохозяйственной продукции, а также с реализацией произведенной и переработанной данными организациями собственной сельскохозяйственной продукции, устанавливается в следующих порядке и размере:
в 2004 - 2012 годах - 0 процентов;
в 2013 - 2015 годах - 18 процентов;
начиная с 2016 года - в соответствии с пунктом 1 статьи 284 НК РФ.
Этим и объясняется добровольность применения ЕСХН.
Единый сельскохозяйственный налог предусматривает замену уплаты совокупности налогов, прямо указанных в статье 346.1 НК РФ, уплатой данного налога.
Кроме того, необходимо учитывать, что в 2010 году применяются пониженные тарифы страховых взносов для сельскохозяйственных товаропроизводителей, отвечающих критериям, указанным в статье 346.2 НК РФ, а также организаций и индивидуальных предпринимателей, применяющих единый сельскохозяйственный налог (статья 57 Федерального закона от 24.07.2009 N 212-ФЗ "О страховых взносах в Пенсионный фонд Российской Федерации, Фонд социального страхования Российской Федерации, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования и территориальные фонды обязательного медицинского страхования"). Пониженные тарифы страховых взносов для организаций и индивидуальных предпринимателей, применяющих единый сельскохозяйственный налог, предусмотрены и в переходный период 2011 - 2014 годов согласно статье 58 указанного Закона.
