При применении статьи 338 НК РФ следует учитывать, что стоимость добытых полезных ископаемых определяется в соответствии со статьей 340 НК РФ.
ФАС Восточно-Сибирского округа в Постановлении от 02.10.2006 N А10-14175/05-Ф02-5100/06-С1 указал, что налоговая база по налогу на добычу полезных ископаемых определяется налогоплательщиком самостоятельно в том числе и в отношении полезных компонентов, извлекаемых из недр попутно при добыче основного полезного ископаемого.
Исчисление НДПИ при добыче газа горючего природного из всех видов месторождений углеводородного сырья производится за весь объем добытого газа независимо от дальнейшего его использования, включая объем газа, закачанного в том же налоговом периоде обратно в недра для целей поддержания пластового давления, осуществления сайклинг-процесса, хранения и т.д. (см., например, письмо Минфина от 18.06.2007 N 03-06-06-01/29).
